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S7847 CpGenome Turbo Bisulfite Modification Kit

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S7847
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      概要

      Replacement Information
      説明
      カタログ番号S7847
      製品名
      • CpGenome
      • Chemicon
      説明CpGenome Turbo Bisulfite Modification Kit
      概要CpGenome Turbo Bisulfite Modification Kitは、バイサルファイト変換プロセスをシンプルに簡素化するよう設計されています。本キットにはバイサルファイト変換に必要な主要な試薬が含まれており、通常3~16時間かかるステップを90分で完了します。この迅速且つ効果的な手法には、変換時間の短縮を可能にする、自社開発の変換試薬混合液を使用しています。この独自の試薬混合液により、非メチル化シトシンを高効率で変換することが可能となり、反応中におけるDNAの分解を最小限に抑えます。DNAが変換され、脱スルホン化された後は、キットに同梱されているスピンカラムを用いて、DNAを精製・溶出します。これにより、マイクロアレイや次世代シークエンサーといった幅広いアプローチで使用可能です。

      主要な特長
      • 90分でバイサルファイト処理を完了
      • 非メチル化シトシンからウラシルへの変換効率99.9 %
      • 最小必要試料は1 ng
      • 反応溶液は25マイクロリットル
      • マイクロアレイ、DNAシークエンス解析など、複数の解析アプローチに適用可能
      Materials Required but Not Delivered機器及び消耗品
      • サーマルサイクラー、ヒートブロックまたは水槽
      • マイクロ遠心器(12,000 x gが可能なもの)
      • スクリューキャップ型マイクロ遠心チューブ、1.5~2.0 mL
      • 測定範囲の狭いpH試験紙(pH 0~6、ストリップ毎に3種類のインジケーター、及び/または、pH 4~7、ストリップ毎に一つのインジケーター)または専用のpH電極
      • ピペット及びピペットチップ(交叉汚染の可能性を最小に抑えるため、エアロゾルバリアーチップをお勧めします)
      • 分析用計量器または測定器


      試薬
      • ヌクレアーゼフリー水
      • 96 ~100 %分子生物学グレードエタノール
      • 12 N HCl
      • 3 N NaOH
      背景情報グアノシン5位でのシトシンのメチル化は、多くの真核生物の遺伝子発現に影響をもたらします。正常な細胞において、メチル化は主にCG配列の少ない領域で起こり、CpGアイランドと呼ばれるCG配列の豊富な領域は非メチル化状態のままです。例外として、刷込み(インプリンティング)遺伝子及びメスの不活性X染色体上の転写不活性化に関与するCpGアイランドは広範にメチル化されています。本来は非メチル化状態であるCpGアイランドの異常なメチル化は、不死化細胞及び形質変換細胞において比較的頻度の高い現象として報告されており、癌抑制遺伝子の転写不活性化に関与しています。

      シトシンのメチル化状態を検出するための手法は既に複数確立されています。これらの手法には、抗体またはメチル化DNA結合ドメインを利用する方法、メチル化DNA感受/非感受性の制限酵素を用いたゲノム・スキャンニング法、オリゴヌクレオチドアレイハイブリダイゼーション法、バイサルファイトゲノムDNAシークエンシング及びメチル化特異的PCR(MSP)法などがあります。

      ゲノムDNAシークエンシングは、時間がかかり多大な労力を要しますが、普遍的な検出手法です。たとえばMSPは、異常なメチル化シトシンをモニタリングする定評のある技術です。この手法では、少量のDNAを用いて、プロモーター領域の5-メチルシトシンを高感度かつ特異的に検出できます。MSPは、癌抑制遺伝子機能を定義し、組織及び体液由来のDNAを精査することで、腫瘍の早期検出の新たな戦略を得るために活用されています。

      バイサルファイトゲノムシーケンシング及びMSPの最初のステップはいずれも、DNA試料のバイサルファイト変換を行うことです。バイサルファイト反応では、高確率に非メチル化シトシンがウラシルに変換されますが、5-メチルシトシンはこの反応を受けません。このように、バイサルファイト処理後のDNA配列は、DNAが元々メチル化されているかいないかによって異なります。また、当初の相補的DNA鎖は、シトシンがウラシルに変換された後、相補的ではなくなります。MSP解析で使用するプライマーは、化学的に誘発される差異に基づき、バイサルファイト感受性の非メチル化鎖またはバイサルファイト耐性のメチル化鎖のいずれかを特異的に増幅するように設計されます。ミリポアは、このようなMSPを用いた遺伝子特異的解析を可能にするCpG Wiz® MSPキットセレクションを提供しています。CpG Wizキット及びMSP技術の詳細は、こちらをクリックしてご覧下さい。
      参考資料
      製品情報
      構成要素
      • バイサルファイト変換試薬1
      • バイサルファイト変換試薬2
      • バイサルファイト試薬希釈剤
      • DNA結合バッファー
      • DNA洗浄バッファー*
      • DNA溶出バッファー
      • 変換DNA精製カラム
      • 2 mL回収チューブ
      • *DNA洗浄バッファーには、100%エタノールの添加が必要です。
      Quality LevelMQ100
      アプリケーション
      アプリケーションThe CpGenome Turbo Bisulfite Modification Kit is designed to simplify & streamline the bisulfite modification process. In just 90 minutes go from DNA sample to bisulfite converted DNA ready for analysis.
      アプリケーションノートMSPのプライマー設計については、MethPrimeソフトウェアパッケージをご利用下さい。こちらをクリックして下さい
      生体情報
      物理化学情報
      寸法
      材料情報
      有害性情報
      GHSに関する安全性情報
      安全性情報
      製品使用について
      使用について
      • Unless otherwise stated in our catalog or other company documentation accompanying the product(s), our products are intended for research use only and are not to be used for any other purpose, which includes but is not limited to, unauthorized commercial uses, in vitro diagnostic uses, ex vivo or in vivo therapeutic uses or any type of consumption or application to humans or animals.
      保管および輸送に関する情報
      パッケージ情報
      数量50 reactions
      輸配送情報
      補足情報
      規格
      Global Trade Item Number
      カタログ番号 GTIN
      S7847 04053252746826

      Documentation

      CpGenome Turbo Bisulfite Modification Kit (M)SDS

      タイトル

      英語版製品安全データシート((M)SDS) 

      参考資料

      参考資料の概要Pub Med ID
      Characterization of induced tissue-specific stem cells from pancreas by a synthetic self-replicative RNA.
      Miyagi-Shiohira, C; Nakashima, Y; Kobayashi, N; Saitoh, I; Watanabe, M; Noguchi, H
      Sci Rep  8  12341  2018

      概要を表示する
      30120295 30120295

      カタログ

      タイトル
      Advancing cancer research: From hallmarks & biomarkers to tumor microenvironment progression
      CpGenome™ Turbo Bisulfite Modification Kit

      技術情報

      タイトル
      White Paper - The Message in the Marks: Deciphering Cancer Epigenetics

      ユーザーガイド

      タイトル
      CpGenome¿ Turbo Bisulfite Modification Kit (50 Reactions) Manual