生細胞RNA構造分析用In Vivo SHAPE試薬

特徴および長所

• すぐに使用できるRNaseフリー溶液
• 毒性が低いため生細胞への使用が可能
• 高い細胞透過性によりRNAの迅速な修飾を実現
• すべてのRNAヌクレオチドと偏りなく反応するため、高分解能マッピングが可能

In Vivo SHAPE試薬は、RNA構造の特定に使用されます。この試薬には、高純度タイプの2-メチルニコチン酸イミダゾリド（NAI）が含まれています。この化合物は、Selective 2’-Hydroxyl Acylation and Primer Extension（SHAPE）によって検出できる2’-O-付加物を、RNAの一本鎖領域で形成します。

SHAPE法に使用される他の試薬とは異なり、NAI–ベースのIn Vivo SHAPE試薬はすぐに細胞に吸収され、また毒性の低い処方となっているため、生細胞への使用に理想的です。In Vivo SHAPE試薬は、SHAPE分析に使用される他の試薬とは異なり、4つのすべてのRNAヌクレオチドと偏りなく反応します。このように毒性が低く、吸収が迅速で、ヌクレオチドの偏りがないことから、さまざまな生物系での高分解能のRNA構造分析が可能となっています。

高次構造体へのフォールディングにより、RNAは生細胞内で機能して、エフェクタータンパク質とともに動的複合体を形成できるようになります。これらの3D構造の予測は困難なため、RNAフォールディングを研究するための数多くのプロービング技術が開発されてきました。

2-メチルニコチン酸イミダゾリド（NAI）などの化合物を含むIn Vivo SHAPE試薬は、2-O-付加物の形成をもたらします。これらの付加物は、一本鎖不対RNA上では速やかに生じ、塩基対（二本鎖）RNA上では緩やかに生じます。修飾されたRNAはその後、プライマー伸長法によって分析できます。修飾されたヌクレオチドは、RNA依存性DNAポリメラーゼによって伸長されないため、修飾部位の検出が可能になります。

DMSO中の2M NAI

DMSO溶液中の2M NAI（>97%純度）を含有する0.5 mLバイアル

自動霜取り機能を備えない冷凍庫に入れ、-20°Cで遮光してNAIを保存してください。適切に（遮光し、過度な凍結・融解サイクルを避けて）保存すれば、本製品は受領日から最長6か月間安定です。

NAI化合物の純度はHPLCにより試験済み。

DMSO中の2-メチルニコチン酸イミダゾリド（NAI）

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