Améliorer l'efficacité de la synthèse en SPPS Fmoc

Les dipeptides pseudoproline sont sans aucun doute les outils les plus puissants à l'heure actuelle pour améliorer l'efficacité de la synthèse SPPS Fmoc. Les avantages de l'utilisation systématique de dipeptides pseudoproline sont les suivants :

• Permet d'éviter de devoir répéter inutilement et à grands frais la synthèse de séquences qui ont échoué ;
• Augmente la pureté des produits bruts ;
• Simplifie la purification par HPLC ;
• Augmente le rendement des produits bruts et purifiés ;
• Permet d'effectuer la synthèse à plus petite échelle.

Insertion de dipeptides pseudoproline

Dans un dipeptide pseudoproline, le résidu Ser ou Thr est protégé de façon réversible pour former une oxazolidine ressemblant à la proline, labile en présence d'acide trifluoroacétique (TFA). L'insertion d'un dipeptide pseudoproline dans une séquence empêche la formation de structures secondaires qui peuvent causer des problèmes au cours de l'assemblage du peptide, ce qui entraîne une meilleure cinétique d'acylation et de déprotection, qui se déroulent de manière plus prévisible. Les résultats les plus impressionnants s'observent dans la préparation de séquences très susceptibles de former des agrégats, où l'insertion d'une seule pseudoproline peut provoquer une augmentation du rendement en produit d'un facteur dix. Toutefois, les taux de réactions améliorés et plus uniformes sont également utiles dans les synthèses de routine, en favorisant le rendement, la pureté et la solubilité des produits bruts et en facilitant la purification par HPLC, ce qui se traduit par une meilleure récupération du produit. Dans le cas des longs peptides, l'incorporation de plusieurs pseudoprolines à intervalles réguliers tout au long de la séquence s'est révélée particulièrement utile.

Les dipeptides pseudoproline sont très faciles à utiliser. Ils sont introduits dans la séquence peptidique par des méthodes standards de couplage, en remplacement de n'importe quel dipeptide Aaa-Ser ou Aaa-Thr. Les conseils d'utilisation suivants ont été empiriquement dérivés de l'expérience :

• Des résultats optimaux sont obtenus lorsque les PP sont espacés de 5 à 6 résidus tout au long de la séquence.
• La séparation optimale entre un PP et un résidu Pro est de 5 à 6 acides aminés.
• La séparation minimale entre un PP et un autre PP ou un résidu Pro est de 2 acides aminés.
• Il est recommandé d'insérer un PP avant une région riche en résidus hydrophobes.