Isoacyl-Dipeptide sind bemerkenswerte neue Werkzeuge zur Steigerung der Syntheseeffizienz bei der Fmoc-SPPS. Die Substitution von Aaa-Ser oder Aaa-Thr in einer Peptidsequenz durch ein Isoacyl-Dipeptid führt zur Bildung eines Depsipeptidanalogs der nativen Sequenz, in dem die Amidbindung zwischen Aaa und Ser bzw. Thr durch eine Esterbindung ersetzt ist. Diese Modifikation führt zu einer deutlichen Änderung in der Konformation der Peptidkette, die in ähnlicher Weise zu einer Störung der Aggregation führt, wie es die Insertion eines Pseudoprolin- oder N-Dmb/Hmb-Restes bewirken würde. Die echten Vorteile der Anwendung von Isoacyl-Dipeptiden werden jedoch deutlich, sobald das Peptid von der Festphase freigesetzt wurde. Anders als bei Pseudoprolin-Dipeptiden ist das abgespaltene Produkt bei der Anwendung von Isoacyl-Dipeptiden das Depsipeptid und nicht die native Peptidsequenz. Es zeigte sich, dass solche Depsipeptidanaloga von aggregationsanfälligen Peptiden besser löslich und infolgedessen leichter zu reinigen sind als die hochgradig strukturierten nativen Peptide.

Für nähere Informationen siehe Innovationen 2/10